El Consejo Nacional de Acreditación, que está compuesto por académicos, preside todo el proceso. Este Consejo organiza los procedimientos, los fiscaliza, da fe de su calidad y finalmente recomienda al Ministro de Educación Nacional acreditar los programas e instituciones que lo merezcan. Además señala metas de crecimiento a las que todavía no llegan los programas o instituciones, según niveles de calidad convenidos.