A partir de Constitución Política de 1991, el Ministerio de Educación Nacional formula los planes, las políticas y establece las normas nacionales en educación; asesora a las entidades territoriales certificadas y evalúa los resultados del servicio educativo. También hace inspección y vigilancia de la educación, y realiza los contactos con otros países y organizaciones internacionales.

Mediante el desarrollo de políticas de cobertura, el Ministerio debe promover la educación en los niveles de preescolar, básica y media, incluyendo las poblaciones en condiciones de vulnerabilidad, con criterios de acceso equitativo, permanencia y equiparación de oportunidades.

Así mismo, a través de políticas de calidad, fomentar la evaluación sistemática y permanente con planes de mejoramiento.

Por último, con políticas de eficiencia lograr que el Ministerio, entidades del sector y secretarías de educación tengan acceso a condiciones técnicas, tecnológicas, administrativas y legales para desarrollar procesos de modernización que faciliten su gestión.

El Ministerio de Educación Nacional fue creado mediante la Ley 7ª del 25 de agosto de 1886. Antes de esta fecha, con la Ley 10ª de 1880, se creó la Secretaría de Instrucción Pública, en reemplazo de la Secretaría del Exterior (Ministerio de Gobierno) que antes de 1880 atendía los asuntos educativos.

En junio de 1923 cambio el nombre de Ministerio de Instrucción Pública por el de Ministerio de Instrucción y Salubridad Públicas. Pero es desde el 1º de enero de 1928 que se le identifica como Ministerio de Educación Nacional (según la Ley 56 de 1927), siendo presidente de la República Miguel Abadía Méndez.